La sezione archeologica raccoglie le testimonianze della città e del suo territorio dall’età neolitica fino al periodo basso medievale.
La collezione orientale è il frutto della raccolta personale di Pier Alessandro Garda, consistente in oltre 500 opere donate alla città nel 1874, e della raccolta di Palazzo Giusiana, prima sede del museo.
La collezione conserva una ricca varietà di oggetti realizzati con diversi materiali: metallo, porcellana, lacca, carta, seta, legno, bambù, avorio, vetro risalenti al periodo Edo e inizio Meiji.
La collezione Croff è composta da quadri di artisti fondamentali per la storia dell’arte italiana donati dalla signora Lucia Guelpa.
Si tratta di una cinquantina di dipinti e disegni, fra i quali alcuni veri capolavori: il dipinto trecentesco Crocifissione con santi di Giovanni del Biondo, l’intenso Ritratto d’uomo di Annibale Carracci, il celebre La Superbiosa di Filadelfo Simi, gli inusuali Pesche sulla frasca e Bosco di lauri di Giorgio De Chirico, il magistrale Ritratto di Cinciarda di Pietro Annigoni. Il museo è sede di mostre.